Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCLRE1BQ9H816 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCLRE1BQ9H816 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCLRE1BQ9H816 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms