Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GFRA4Q9GZZ7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GFRA4Q9GZZ7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.9 ms