Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD2

MRPL9, 39S ribosomal protein L9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL9Q9BYD2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL9Q9BYD2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL9Q9BYD2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL9Q9BYD2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL9Q9BYD2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL9Q9BYD2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL9Q9BYD2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MRPL9Q9BYD2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL9Q9BYD2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL9Q9BYD2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL9Q9BYD2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL9Q9BYD2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms