Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUP85Q9BW27 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP85Q9BW27 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms