Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EFHD1Q9BUP0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFHD1Q9BUP0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFHD1Q9BUP0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFHD1Q9BUP0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EFHD1Q9BUP0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFHD1Q9BUP0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFHD1Q9BUP0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EFHD1Q9BUP0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EFHD1Q9BUP0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EFHD1Q9BUP0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EFHD1Q9BUP0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFHD1Q9BUP0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EFHD1Q9BUP0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFHD1Q9BUP0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms