Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTRQ99707 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTRQ99707 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTRQ99707 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTRQ99707 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTRQ99707 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MTRQ99707 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTRQ99707 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MTRQ99707 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTRQ99707 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTRQ99707 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTRQ99707 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTRQ99707 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTRQ99707 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTRQ99707 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTRQ99707 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTRQ99707 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTRQ99707 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTRQ99707 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTRQ99707 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTRQ99707 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTRQ99707 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTRQ99707 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTRQ99707 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTRQ99707 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTRQ99707 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTRQ99707 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTRQ99707 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTRQ99707 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTRQ99707 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTRQ99707 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTRQ99707 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTRQ99707 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MTRQ99707 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTRQ99707 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTRQ99707 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTRQ99707 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTRQ99707 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTRQ99707 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTRQ99707 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTRQ99707 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTRQ99707 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTRQ99707 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MTRQ99707 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTRQ99707 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MTRQ99707 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTRQ99707 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTRQ99707 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTRQ99707 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTRQ99707 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTRQ99707 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTRQ99707 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MTRQ99707 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MTRQ99707 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MTRQ99707 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTRQ99707 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTRQ99707 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTRQ99707 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTRQ99707 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTRQ99707 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTRQ99707 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTRQ99707 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTRQ99707 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTRQ99707 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTRQ99707 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTRQ99707 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTRQ99707 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTRQ99707 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTRQ99707 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTRQ99707 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTRQ99707 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTRQ99707 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTRQ99707 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTRQ99707 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTRQ99707 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTRQ99707 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTRQ99707 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTRQ99707 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTRQ99707 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTRQ99707 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTRQ99707 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTRQ99707 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTRQ99707 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTRQ99707 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTRQ99707 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTRQ99707 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTRQ99707 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTRQ99707 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTRQ99707 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTRQ99707 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTRQ99707 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTRQ99707 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTRQ99707 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTRQ99707 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MTRQ99707 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTRQ99707 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTRQ99707 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTRQ99707 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MTRQ99707 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTRQ99707 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms