Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GBP4Q96PP9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP4Q96PP9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GBP4Q96PP9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GBP4Q96PP9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.1 ms