Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL1

TMEM74, Transmembrane protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM74Q96NL1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM74Q96NL1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM74Q96NL1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms