Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM227BQ96M60 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM227BQ96M60 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms