Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNBD2Q96M20 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNBD2Q96M20 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms