Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.91■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
COG3Q96JB2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
COG3Q96JB2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms