Protein–RNA interactions for Protein: Q96IZ5

RBM41, RNA-binding protein 41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM41Q96IZ5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM41Q96IZ5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM41Q96IZ5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBM41Q96IZ5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBM41Q96IZ5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM41Q96IZ5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM41Q96IZ5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM41Q96IZ5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM41Q96IZ5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM41Q96IZ5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM41Q96IZ5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM41Q96IZ5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM41Q96IZ5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM41Q96IZ5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM41Q96IZ5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM41Q96IZ5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM41Q96IZ5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms