Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLGN4YQ8NFZ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN4YQ8NFZ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN4YQ8NFZ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms