Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DNERQ8NFT8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DNERQ8NFT8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNERQ8NFT8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms