Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU7

C2CD4A, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4AQ8NCU7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C2CD4AQ8NCU7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2CD4AQ8NCU7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2CD4AQ8NCU7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.3 ms