Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC191Q8NCU4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC191Q8NCU4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC191Q8NCU4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC191Q8NCU4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC191Q8NCU4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC191Q8NCU4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC191Q8NCU4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms