Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX31Q8N9S9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX31Q8N9S9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.8 ms