Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUF8

RIOX2, Ribosomal oxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX2Q8IUF8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RIOX2Q8IUF8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RIOX2Q8IUF8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
RIOX2Q8IUF8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RIOX2Q8IUF8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RIOX2Q8IUF8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIOX2Q8IUF8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIOX2Q8IUF8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIOX2Q8IUF8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIOX2Q8IUF8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIOX2Q8IUF8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RIOX2Q8IUF8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIOX2Q8IUF8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RIOX2Q8IUF8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIOX2Q8IUF8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIOX2Q8IUF8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIOX2Q8IUF8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RIOX2Q8IUF8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms