Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PPARGC1BQ86YN6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PPARGC1BQ86YN6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PPARGC1BQ86YN6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms