Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHLHA9Q7RTU4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BHLHA9Q7RTU4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms