Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP30Q70CQ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP30Q70CQ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
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