Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFXL1Q6ZNB6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
NFXL1Q6ZNB6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFXL1Q6ZNB6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms