Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRIP3Q6Q6R5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRIP3Q6Q6R5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRIP3Q6Q6R5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms