Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LETMD1Q6P1Q0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LETMD1Q6P1Q0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LETMD1Q6P1Q0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms