Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
APOBEC3HQ6NTF7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOBEC3HQ6NTF7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOBEC3HQ6NTF7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
APOBEC3HQ6NTF7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms