Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF17Q5VTA0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF17Q5VTA0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF17Q5VTA0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms