Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPL39P5Q59GN2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL39P5Q59GN2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL39P5Q59GN2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms