Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFT2D3Q587I9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SFT2D3Q587I9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFT2D3Q587I9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms