Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ME3Q16798 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ME3Q16798 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ME3Q16798 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ME3Q16798 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ME3Q16798 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ME3Q16798 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ME3Q16798 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ME3Q16798 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ME3Q16798 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ME3Q16798 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ME3Q16798 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ME3Q16798 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ME3Q16798 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ME3Q16798 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ME3Q16798 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ME3Q16798 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
ME3Q16798 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ME3Q16798 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ME3Q16798 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ME3Q16798 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ME3Q16798 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ME3Q16798 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ME3Q16798 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ME3Q16798 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ME3Q16798 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ME3Q16798 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ME3Q16798 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ME3Q16798 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ME3Q16798 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ME3Q16798 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ME3Q16798 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ME3Q16798 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ME3Q16798 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ME3Q16798 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ME3Q16798 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ME3Q16798 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ME3Q16798 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ME3Q16798 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ME3Q16798 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ME3Q16798 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ME3Q16798 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ME3Q16798 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ME3Q16798 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ME3Q16798 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ME3Q16798 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ME3Q16798 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ME3Q16798 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ME3Q16798 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ME3Q16798 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ME3Q16798 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ME3Q16798 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ME3Q16798 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ME3Q16798 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ME3Q16798 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ME3Q16798 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ME3Q16798 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ME3Q16798 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ME3Q16798 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ME3Q16798 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ME3Q16798 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ME3Q16798 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ME3Q16798 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ME3Q16798 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ME3Q16798 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ME3Q16798 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ME3Q16798 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ME3Q16798 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ME3Q16798 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ME3Q16798 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ME3Q16798 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ME3Q16798 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ME3Q16798 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ME3Q16798 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ME3Q16798 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ME3Q16798 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ME3Q16798 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ME3Q16798 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ME3Q16798 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ME3Q16798 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ME3Q16798 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ME3Q16798 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ME3Q16798 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ME3Q16798 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ME3Q16798 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ME3Q16798 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ME3Q16798 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ME3Q16798 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ME3Q16798 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ME3Q16798 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ME3Q16798 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ME3Q16798 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ME3Q16798 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ME3Q16798 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ME3Q16798 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ME3Q16798 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ME3Q16798 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ME3Q16798 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ME3Q16798 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ME3Q16798 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
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