Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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TWIST1Q15672 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TWIST1Q15672 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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TWIST1Q15672 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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TWIST1Q15672 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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TWIST1Q15672 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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TWIST1Q15672 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TWIST1Q15672 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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TWIST1Q15672 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TWIST1Q15672 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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