Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SQLEQ14534 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SQLEQ14534 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SQLEQ14534 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms