Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SCN5AQ14524 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN5AQ14524 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN5AQ14524 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
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