Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MADCAM1Q13477 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MADCAM1Q13477 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MADCAM1Q13477 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MADCAM1Q13477 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MADCAM1Q13477 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MADCAM1Q13477 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MADCAM1Q13477 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MADCAM1Q13477 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MADCAM1Q13477 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MADCAM1Q13477 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MADCAM1Q13477 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MADCAM1Q13477 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MADCAM1Q13477 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MADCAM1Q13477 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MADCAM1Q13477 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MADCAM1Q13477 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MADCAM1Q13477 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MADCAM1Q13477 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MADCAM1Q13477 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MADCAM1Q13477 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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