Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SRSF5Q13243 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRSF5Q13243 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRSF5Q13243 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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