Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
EXOSC9Q06265 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EXOSC9Q06265 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EXOSC9Q06265 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
EXOSC9Q06265 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EXOSC9Q06265 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms