Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
APBA1Q02410 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APBA1Q02410 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APBA1Q02410 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 340.6 ms