Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFI35P80217 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IFI35P80217 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IFI35P80217 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFI35P80217 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFI35P80217 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFI35P80217 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFI35P80217 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IFI35P80217 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFI35P80217 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFI35P80217 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFI35P80217 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFI35P80217 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFI35P80217 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFI35P80217 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFI35P80217 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFI35P80217 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFI35P80217 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IFI35P80217 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFI35P80217 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFI35P80217 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFI35P80217 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFI35P80217 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFI35P80217 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFI35P80217 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFI35P80217 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFI35P80217 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFI35P80217 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFI35P80217 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFI35P80217 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFI35P80217 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFI35P80217 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFI35P80217 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFI35P80217 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFI35P80217 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFI35P80217 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFI35P80217 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFI35P80217 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFI35P80217 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFI35P80217 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFI35P80217 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFI35P80217 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFI35P80217 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFI35P80217 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFI35P80217 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFI35P80217 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFI35P80217 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFI35P80217 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFI35P80217 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFI35P80217 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFI35P80217 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFI35P80217 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFI35P80217 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
IFI35P80217 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFI35P80217 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFI35P80217 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFI35P80217 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFI35P80217 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFI35P80217 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFI35P80217 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFI35P80217 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFI35P80217 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFI35P80217 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFI35P80217 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFI35P80217 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFI35P80217 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFI35P80217 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFI35P80217 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFI35P80217 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFI35P80217 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFI35P80217 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFI35P80217 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFI35P80217 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IFI35P80217 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IFI35P80217 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IFI35P80217 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFI35P80217 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFI35P80217 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFI35P80217 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFI35P80217 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFI35P80217 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFI35P80217 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFI35P80217 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFI35P80217 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IFI35P80217 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFI35P80217 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFI35P80217 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFI35P80217 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFI35P80217 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFI35P80217 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFI35P80217 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFI35P80217 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFI35P80217 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFI35P80217 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFI35P80217 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFI35P80217 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFI35P80217 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFI35P80217 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFI35P80217 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFI35P80217 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms