Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYP4F2P78329 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F2P78329 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP4F2P78329 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms