Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBE2HP62256 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBE2HP62256 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE2HP62256 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms