Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMC1P62191 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC1P62191 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMC1P62191 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC1P62191 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC1P62191 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC1P62191 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC1P62191 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC1P62191 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC1P62191 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC1P62191 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC1P62191 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC1P62191 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC1P62191 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMC1P62191 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMC1P62191 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMC1P62191 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMC1P62191 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PSMC1P62191 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMC1P62191 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMC1P62191 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMC1P62191 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMC1P62191 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms