Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00205P59089 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00205P59089 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00205P59089 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms