Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RTP1P59025 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RTP1P59025 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RTP1P59025 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RTP1P59025 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RTP1P59025 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RTP1P59025 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTP1P59025 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTP1P59025 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTP1P59025 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTP1P59025 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTP1P59025 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTP1P59025 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTP1P59025 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTP1P59025 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTP1P59025 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTP1P59025 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RTP1P59025 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTP1P59025 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RTP1P59025 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTP1P59025 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTP1P59025 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTP1P59025 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RTP1P59025 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTP1P59025 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTP1P59025 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTP1P59025 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RTP1P59025 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RTP1P59025 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RTP1P59025 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RTP1P59025 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RTP1P59025 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RTP1P59025 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RTP1P59025 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RTP1P59025 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RTP1P59025 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RTP1P59025 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RTP1P59025 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTP1P59025 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTP1P59025 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTP1P59025 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTP1P59025 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTP1P59025 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RTP1P59025 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTP1P59025 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTP1P59025 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTP1P59025 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RTP1P59025 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTP1P59025 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTP1P59025 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTP1P59025 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTP1P59025 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RTP1P59025 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RTP1P59025 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RTP1P59025 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RTP1P59025 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RTP1P59025 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTP1P59025 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTP1P59025 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTP1P59025 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTP1P59025 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTP1P59025 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RTP1P59025 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTP1P59025 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTP1P59025 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTP1P59025 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTP1P59025 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTP1P59025 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTP1P59025 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTP1P59025 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTP1P59025 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTP1P59025 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RTP1P59025 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTP1P59025 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTP1P59025 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTP1P59025 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTP1P59025 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTP1P59025 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTP1P59025 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RTP1P59025 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RTP1P59025 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RTP1P59025 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTP1P59025 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RTP1P59025 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RTP1P59025 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTP1P59025 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTP1P59025 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTP1P59025 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTP1P59025 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RTP1P59025 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTP1P59025 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTP1P59025 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTP1P59025 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTP1P59025 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RTP1P59025 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTP1P59025 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTP1P59025 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RTP1P59025 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RTP1P59025 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RTP1P59025 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms