Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BRPF1P55201 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BRPF1P55201 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
BRPF1P55201 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BRPF1P55201 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms