Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCPP55072 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCPP55072 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VCPP55072 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCPP55072 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCPP55072 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCPP55072 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VCPP55072 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCPP55072 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCPP55072 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCPP55072 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCPP55072 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCPP55072 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VCPP55072 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCPP55072 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCPP55072 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCPP55072 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VCPP55072 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCPP55072 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCPP55072 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCPP55072 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCPP55072 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCPP55072 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCPP55072 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCPP55072 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCPP55072 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCPP55072 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCPP55072 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCPP55072 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCPP55072 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCPP55072 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCPP55072 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCPP55072 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCPP55072 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCPP55072 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCPP55072 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCPP55072 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCPP55072 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCPP55072 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCPP55072 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCPP55072 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCPP55072 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VCPP55072 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VCPP55072 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCPP55072 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCPP55072 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCPP55072 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCPP55072 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCPP55072 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCPP55072 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCPP55072 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCPP55072 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCPP55072 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCPP55072 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCPP55072 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VCPP55072 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCPP55072 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VCPP55072 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCPP55072 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCPP55072 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCPP55072 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCPP55072 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VCPP55072 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCPP55072 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VCPP55072 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VCPP55072 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VCPP55072 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCPP55072 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCPP55072 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VCPP55072 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VCPP55072 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCPP55072 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCPP55072 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCPP55072 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCPP55072 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCPP55072 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VCPP55072 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCPP55072 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCPP55072 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCPP55072 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCPP55072 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCPP55072 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCPP55072 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCPP55072 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCPP55072 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCPP55072 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCPP55072 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCPP55072 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCPP55072 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCPP55072 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCPP55072 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCPP55072 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCPP55072 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCPP55072 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCPP55072 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCPP55072 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCPP55072 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VCPP55072 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCPP55072 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VCPP55072 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms