Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMS1P54277 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMS1P54277 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMS1P54277 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PMS1P54277 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PMS1P54277 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PMS1P54277 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PMS1P54277 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PMS1P54277 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PMS1P54277 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMS1P54277 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMS1P54277 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMS1P54277 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMS1P54277 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMS1P54277 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMS1P54277 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMS1P54277 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMS1P54277 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMS1P54277 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMS1P54277 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PMS1P54277 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMS1P54277 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMS1P54277 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMS1P54277 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMS1P54277 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMS1P54277 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PMS1P54277 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PMS1P54277 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PMS1P54277 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PMS1P54277 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PMS1P54277 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PMS1P54277 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PMS1P54277 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PMS1P54277 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PMS1P54277 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PMS1P54277 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PMS1P54277 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PMS1P54277 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PMS1P54277 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PMS1P54277 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PMS1P54277 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PMS1P54277 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PMS1P54277 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PMS1P54277 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PMS1P54277 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PMS1P54277 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PMS1P54277 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PMS1P54277 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PMS1P54277 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PMS1P54277 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PMS1P54277 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PMS1P54277 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PMS1P54277 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PMS1P54277 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PMS1P54277 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PMS1P54277 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PMS1P54277 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PMS1P54277 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PMS1P54277 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PMS1P54277 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PMS1P54277 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PMS1P54277 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PMS1P54277 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PMS1P54277 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PMS1P54277 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PMS1P54277 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PMS1P54277 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PMS1P54277 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PMS1P54277 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PMS1P54277 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PMS1P54277 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PMS1P54277 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PMS1P54277 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PMS1P54277 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PMS1P54277 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PMS1P54277 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PMS1P54277 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PMS1P54277 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PMS1P54277 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PMS1P54277 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PMS1P54277 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PMS1P54277 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PMS1P54277 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PMS1P54277 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PMS1P54277 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PMS1P54277 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PMS1P54277 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PMS1P54277 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PMS1P54277 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PMS1P54277 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PMS1P54277 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PMS1P54277 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PMS1P54277 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PMS1P54277 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PMS1P54277 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PMS1P54277 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PMS1P54277 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PMS1P54277 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PMS1P54277 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PMS1P54277 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms