Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC42.92■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
SMARCA4P51532 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC42.85■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC42.84■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC42.82■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
SMARCA4P51532 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
SMARCA4P51532 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC42.72■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
SMARCA4P51532 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
SMARCA4P51532 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms