Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A3P48764 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A3P48764 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A3P48764 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A3P48764 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A3P48764 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A3P48764 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A3P48764 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A3P48764 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A3P48764 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A3P48764 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A3P48764 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A3P48764 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A3P48764 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A3P48764 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A3P48764 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A3P48764 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A3P48764 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A3P48764 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A3P48764 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A3P48764 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A3P48764 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A3P48764 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A3P48764 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A3P48764 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A3P48764 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A3P48764 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A3P48764 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A3P48764 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A3P48764 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A3P48764 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A3P48764 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A3P48764 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A3P48764 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A3P48764 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A3P48764 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A3P48764 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A3P48764 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A3P48764 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A3P48764 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A3P48764 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A3P48764 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms