Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A3P48751 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC4A3P48751 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC4A3P48751 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.6 ms