Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTDSS1P48651 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTDSS1P48651 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms