Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RANGAP1P46060 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC37.88■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RANGAP1P46060 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1258.9 ms